自《素问》以来，历代医家莫不重视标本二字，然何者为本，何者为标，大都不甚了了。
细读《素问》“标本病传论”和“至真要大论”，其论标本者，一日阴阳与六气关系的标本，二日病因病机关系的标本。至论治法，若阴阳六气关系的标本，由于阴阳中的少阳转化为六气时表现为火，太阴转化为六气时表现为湿，少阴转化为热或寒，太阳转化为热或寒，阳明转化为湿，厥阴转化为火，所以在治疗上有从调体内阴阳和治六气的不同办法。正如《素问·至真要大论》所说：“六气标本，所从不同……少阳太阴从本，少阴太阳从本从标，阳明厥阴不从标本，从乎中也。故从本者化生于本，从标本者有标本之化，从中者以中气为化也。”张介宾《类经》说：“六气少阳为相火，是少阳从火而化，故火为本，少阳为标。太阴为湿土，是太阴从湿而化，故湿为本，太阴为标。”“少阴为君火，从热而化，故热为本，少阴为标，是阴从乎阳也。太阳为寒水，从寒而化，故寒为本，太阳为标，是阳从乎阴也。”“阳明为燥金，从燥而化，故燥为本，阳明为标。厥阴为风木，从风而化，故风为本，厥阴为标。但阳明太阴为表里，故以太阴为中气，而金从湿土之化。厥阴与少阳为表里，故以少阳为中气，而木从相火之化，是皆从乎中也。”《素问·至真要大论》说：“是故百病之起，有生于本者，有生于标者，有生于中气者，有取本而得者，有取标而得者，有取中气而得者，有取标本而得者，有逆取而得者，有从取而得者。逆，正顺也；若顺，逆也。故日知标与本，用之不殆，明知逆顺，正行无问，此之谓也。”若病因病机关系的标本，在治疗上除中满、二便不利、泄利之外，一般均应从治病因着手，《素问·标本病传论》云：“夫阴阳逆从标本之为道也……先病而后逆者治其本，先逆而后病者治其本，先寒而后生病者治其本，先病而后生寒者治其本，先热而后生病者治其本，先热而后生中满者治其标，先病而后泄者治其本，先泄而后生他病者治其本，必且调之，乃治其他病。先病而后生中满者治其标，先中满而后烦心者治其本，人有客气有同气，小大不利治其标，小大利治其本。”
张景岳另著《标本论》于《景岳全书》中更明确说明“病有标本者，本为病之源，标为病之变。”所以主张治病只有一法即治本也。并在《求本论》一文中说：“万事皆有本，而治病之法尤惟求本为首务。所谓本者惟一而无两也。盖或因外感者本于表也，或因内伤者本于里也，或病热者本于火也，或病冷者本于寒也，邪有余者本于实也，正不足者本于虚也，但察其因何而起，起病之因便是病本。万病之本，只此表里寒热虚实六者而已，知此六者，则表有表证，里有里证，寒热虚实无不皆然，六者两为对待则冰炭不同，辨之亦异。”充分地阐明了若论病因病机关系者治疗之时应从治本。至若由阴阳而六气之变者，治本尤当调其阴阳，他在《类经》治病必求于本注释中说：“本，致病之源也。人之疾病，或在表，或在里，或为寒，或为热，或感于五运六气，或伤于脏腑经络，皆不外阴阳二气，必有所本，故或本于阴，或本于阳，病变虽多，其本则一，知病所从生，知乱所由起，而直取之，是为得一之道。”但是什么时候治本从病因，什么时候治本从阴阳，还是不够明确。余思四十余年，今始得解：即急病之从本者从病因，久病之从本者从阴阳也。
