《药征》曰：「柴胡，主治胸胁苦满也，兼治寒热往来，腹中痛，胁下痞硬。」
历观上方，柴胡主治胸胁苦满也。其它治往来寒热，或腹中痛，或呕吐，或小便不利者，此一方之所主治，非一味之所主治也。为则按：「《伤寒论》中寒热、腹痛、呕吐、小便不利等，不用柴胡者多。若胸胁苦满而有前证者，则主以柴胡，因此可知柴胡之所主治矣。」
《本草纲目》柴胡部中，往往以寒热往来为其主治。夫世之所谓痞疾，其寒热往来也剧，有用柴胡治愈者，有不愈者，于是质之仲景之书，其用柴胡也，无不有胸胁苦满证。今乃施诸胸胁苦满而寒热往来者，其应犹响。不仅疟疾如是，百疾莫不皆然。无胸胁苦满证者，则用之无效。是则柴胡之所主治也，在彼而不在此矣。古来未正解仲景之书者，莫不以柴胡为一种之解热药。自东洞翁蹶起，高唱前说后，世医始得其真面目，故以此为本药之应用主目的。
《本草纲目》曰
柴胡根
【气味】苦平无毒。
【主治】心腹肠胃中结气，饮食积聚，寒热邪气，推陈致新，…明目益精。(《本经》)
【注】结气，谓无形物之聚集。积聚，谓有形物之凝结。故饮食积聚者，即食水二毒凝集之谓也。
除伤寒心下烦热，诸痰热结实，…大肠停积，水胀，及湿痹拘挛。亦可作浴汤。(《别录》)
【注】痰热结实，水热二毒凝结之意，如胸胁苦满，亦属此类。停积，与积聚同义。水胀，水肿也。湿痹拘挛者，水气性麻痹兼肌肉挛急之意，即脚气及类似此证之谓也。
治热劳之骨节烦疼，热气，肩背疼痛，劳乏羸瘦。下气消食，宣畅气血，主时疾之内外热不解。(甄权)
【注】热劳，有热性肺结核也。肩背疼痛，颈项强也。时疾，流行性疾患也。
除烦，止惊，益气力，消痰，止嗽，润心肺，添精髓，治健忘。(大明)
除虚劳，散肌热，去早晨潮热，寒热往来，胆瘅，妇人产前产后诸热，心下痞，胸胁痛。治头痛眩晕、目昏赤痛障翳，耳聋耳鸣，诸疟及…妇人热入血室，经水不调，小儿痘疹之余热，五疳之羸热。(时珍)
【注】疳者，不问原因如何，是小儿羸瘦衰弱、神经过敏等证候的病名之总称也。
《本草备要》曰：「柴胡，苦微寒。…宣畅气血，散结，调经。…治伤寒邪热，痰热结实，虚劳肌热，心下烦热，诸疟寒热，头眩，目赤，呕吐，胁痛，口苦，耳聋，妇人热入血室，胎前产后诸热，小儿痘疹，五疳羸热。散十二经之疮疽、血凝、气聚，效同连翘。」
《纲目》及《备要》所论，概涉及问题之枝叶，不无擅弄抽象的文字之弊。但皆由诸家实历之成果，不无扩充仲景学说之处。学者宜分其真伪而取之以为本药应用之副目的。
