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《本草经解》卷一草部上: 人参; 黄; 术; 甘草; 山药; 薏苡仁; 何首乌; 百合; 菟丝子; 淫羊藿; 巴戟天; 肉苁蓉; 地黄; 天门冬; 麦门冬; 葳蕤; 牛膝; 续断; 五味子; 沙参; 芍药; 当归; 紫菀; 知母; 秦艽; 石斛; 延胡索; 细辛; 小茴香; 远志; 菖蒲; 肉豆蔻; 附子; 补骨脂; 益智子; 木香; 半夏
《本草经解》卷二草部下: 白豆蔻; 白蒺藜; 缩砂仁; 姜黄; 郁金; 款冬花; 旋覆花; 藿香; 前胡; 羌活; 升麻; 川芎; 防风; 葛根; 麻黄; 白芷; 本; 柴胡; 桔梗; 茵陈; 夏枯草; 丹参; 益母子; 红花; 香附; 贝母; 葶苈子; 元参; 天花粉; 牛蒡子; 甘菊花; 丹皮; 黄连; 黄芩; 连翘; 天麻; 木通; 车前子; 泽泻; 萆; 防己; 大黄; 灯心草; 使君子
《本草经解》卷三木部: 枸杞子; 金樱子; 杜仲; 茯苓; 茯神; 松花; 山茱萸; 柏子仁; 酸枣仁; 女贞子; 肉桂; 桂枝; 吴茱萸; 丁香; 蜀椒; 沉香; 乌药; 降真香; 苏方木; 蔓荆子; 桑皮; 桑叶; 槐花; 黄柏; 山栀仁; 琥珀; 猪苓; 枳实; 枳壳; 槟榔; 浓朴
《本草经解》卷三竹部: 竹叶; 竹茹; 竹沥
《本草经解》卷三果部: 莲子; 陈皮; 青皮; 大枣; 芡实; 木瓜; 乌梅; 枇杷叶; 龙眼肉; 山楂子; 杏仁; 桃仁
《本草经解》卷四金石部: 铁衣; 丹砂; 芒硝; 滑石; 石膏; 磁石; 代赭石; 紫石英; 赤石脂
《本草经解》卷四谷菜部: 粳米; 小麦; 马料豆; 绿豆; 扁豆; 脂麻仁; 谷芽; 豆豉; 红曲; 神曲; 醋; 酒; 饴糖; 干姜; 生姜; 荆芥; 薄荷; 香薷; 紫苏; 葱白; 薤白; 白芥子; 五灵脂; 龙骨; 鹿茸; 白胶; 阿胶; 羚羊角; 犀角; 虎骨; 石蜜; 乌贼鱼骨; 鳖甲; 龟甲; 牡蛎
《本草经解》卷四人部: 人乳; 小便; 紫河车